Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSPNQ9HAW4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSPNQ9HAW4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms