Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms