Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms