Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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