Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF17Q9BXT8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms