Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms