Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms