Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERPUD2Q9BSE4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms