Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRPF18Q99633 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRPF18Q99633 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PRPF18Q99633 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPF18Q99633 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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