Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELF4Q99607 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms