Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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