Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP47Q96K76 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP47Q96K76 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP47Q96K76 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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