Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTV1Q96GA3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms