Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMD3Q96D46 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms