Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDF1Q96CC6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms