Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA6Q92908 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms