Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms