Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MSL3Q8N5Y2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms