Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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