Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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RAB11FIP4Q86YS3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB11FIP4Q86YS3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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