Protein–RNA interactions for Protein: Q86UD5

SLC9B2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B2Q86UD5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC9B2Q86UD5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms