Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q71RC1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q71RC1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q71RC1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q71RC1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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