Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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