Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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C9orf135Q5VTT2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf135Q5VTT2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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