Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRAMEF20Q5VT98 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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