Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIF1Q5UIP0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms