Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAGI3Q5TCQ9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms