Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms