Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms