Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D3Q587I9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms