Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms