Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PLEKHN1Q494U1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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