Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP13-4Q3LI77 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms