Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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