Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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FAM187BQ17R55 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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