Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms