Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms