Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNHIT3Q15649 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms