Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TAF13Q15543 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms