Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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