Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TLR1Q15399 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms