Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms