Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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