Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD3Q15054 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD3Q15054 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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