Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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