Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMC1AQ14683 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMC1AQ14683 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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