Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTTNQ14247 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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