Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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GTF2H2Q13888 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GTF2H2Q13888 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GTF2H2Q13888 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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