Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NCOA4Q13772 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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