Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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